Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RIGQ13278 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RIGQ13278 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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