Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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