Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC16Q13042 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC16Q13042 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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