Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRDM2Q13029 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
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