Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSTF3Q12996 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSTF3Q12996 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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