Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRIN2AQ12879 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms