Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFIAQ12857 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms