Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSRP1Q08945 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms