Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CD300CQ08708 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD300CQ08708 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms