Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPAQ06546 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPAQ06546 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPAQ06546 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABPAQ06546 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABPAQ06546 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms