Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CHRNEQ04844 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms