Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOP2BQ02880 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms