Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC6A3Q01959 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms