Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POU5F1Q01860 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms