Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAP1Q01518 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms