Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK3Q00526 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms