Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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FAM3AP98173 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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