Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRB1P82279 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRB1P82279 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRB1P82279 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms