Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCS1P62166 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCS1P62166 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCS1P62166 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms