Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS3AP61247 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms