Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms