Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms