Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXA1P49639 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms