Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNNI2P48788 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNI2P48788 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms