Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRATP43155 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRATP43155 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRATP43155 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CRATP43155 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRATP43155 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms