Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF5P43026 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF5P43026 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms