Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms