Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC27P30260 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC27P30260 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDC27P30260 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC27P30260 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC27P30260 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC27P30260 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDC27P30260 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDC27P30260 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDC27P30260 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDC27P30260 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms