Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD6P30203 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD6P30203 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD6P30203 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD6P30203 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD6P30203 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD6P30203 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD6P30203 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD6P30203 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD6P30203 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms