Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EPHA3P29320 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms