Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NMBRP28336 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NMBRP28336 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NMBRP28336 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms