Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IL3RAP26951 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IL3RAP26951 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IL3RAP26951 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IL3RAP26951 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IL3RAP26951 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IL3RAP26951 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms