Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD27P26842 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD27P26842 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD27P26842 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms