Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PLNP26678 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PLNP26678 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PLNP26678 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms