Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms