Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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