Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CREB1P16220 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREB1P16220 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREB1P16220 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms