Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms