Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOP1P11387 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOP1P11387 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOP1P11387 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms