Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHDP01880 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHDP01880 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHDP01880 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHDP01880 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHDP01880 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms