Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFDP00746 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFDP00746 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFDP00746 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFDP00746 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFDP00746 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFDP00746 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFDP00746 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms