Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA10O75578 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms