Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MOV10-203ENST00000369645 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.498e-9■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 MOV10-201ENST00000357443 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-9■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 MOV10-202ENST00000369644 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 MOV10-206ENST00000468624 4689 ntTSL 59.08□□□□□ -0.968e-9■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 MOV10-217ENST00000496577 4312 ntTSL 28.9□□□□□ -0.998e-9■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 130.9
SF3B1O75533 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 324.89■■□□□ 1.584e-6■■■■■ 130.8
SF3B1O75533 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 310.51□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 130.8
SF3B1O75533 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.243e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-203ENST00000517459 224 ntTSL 222.05■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-207ENST00000521185 584 ntTSL 420.53■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-208ENST00000521912 699 ntTSL 320.53■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-205ENST00000520290 703 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-204ENST00000519730 413 ntTSL 413.98□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 213.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF395-209ENST00000522795 501 ntTSL 313.72□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.995e-7■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 TXNL1-205ENST00000587613 934 ntTSL 315.11■□□□□ 0.019e-18■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 SSBP3-211ENST00000528787 577 ntTSL 48.55□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 130.7
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 130.6
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 130.6
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 130.6
SF3B1O75533 MPZL1-205ENST00000448405 1596 ntTSL 1 (best)25.04■■□□□ 1.68e-8■■■■■ 130.5
SF3B1O75533 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.88e-8■■■■■ 130.5
SF3B1O75533 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 130.5
SF3B1O75533 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.018e-8■■■■■ 130.5
SF3B1O75533 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 423.84■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 421.17■□□□□ 0.984e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 220.48■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 519.62■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 218.81■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 130.4
SF3B1O75533 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 130.3
SF3B1O75533 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 512.26□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 IRF1-208ENST00000472045 5153 ntTSL 212.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 IRF1-201ENST00000245414 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 STRN-203ENST00000495595 1026 ntTSL 1 (best)3.28□□□□□ -1.887e-8■■■■■ 130.2
SF3B1O75533 LRCH4-210ENST00000498539 819 ntTSL 317.39■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 SFXN5-203ENST00000411783 915 ntTSL 316.62■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 SFXN5-202ENST00000410065 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 SFXN5-207ENST00000461352 3578 ntTSL 1 (best)12.04□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 SFXN5-211ENST00000474528 4072 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 MBD5-206ENST00000473478 484 ntTSL 411.45□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 130.1
SF3B1O75533 RAF1-202ENST00000416093 962 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 130
SF3B1O75533 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 130
SF3B1O75533 HEXDC-211ENST00000582315 873 ntTSL 526.72■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 HEXDC-207ENST00000578775 779 ntTSL 322.06■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 HDAC5-211ENST00000592385 2601 ntTSL 515.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 220.6■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 129.9
SF3B1O75533 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 129.8
SF3B1O75533 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TBC1D17-207ENST00000599049 1742 ntTSL 516.57■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TMED10-204ENST00000555873 1161 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TMED10-203ENST00000555085 553 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 CBLB-201ENST00000264122 6780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.76■■□□□ 1.715e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 325.59■■□□□ 1.695e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 224.94■■□□□ 1.585e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 219.47■□□□□ 0.715e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 129.7
SF3B1O75533 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 129.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1325.9 ms