Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DHHO43323 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DHHO43323 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DHHO43323 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DHHO43323 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DHHO43323 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms