Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3EO15041 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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