Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HIP1O00291 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HIP1O00291 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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