Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DFFAO00273 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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