Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QRK9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QRK9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QRK9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms