Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KRW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KRW8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KRW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KRW8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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