Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E9PCH4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
E9PCH4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
E9PCH4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
E9PCH4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E9PCH4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
E9PCH4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms